张锋再造三合一组合抑制剂的新型CRISPR Cas13系统

昨日，麻省理工学院和哈佛Broad研究成果所传来好消息：Pardis C. Sabeti、张锋等研究者联合研发出一种新型的抗菌株该系统。全球适度上有许多常见的致命病原体都是基于双螺旋RNA的菌株，像是埃博拉菌株、寨卡菌株和流感菌株。该该系统在CRISPR Cas13技术研发的基础上终于适配，可用作样品和破坏有机体肝细胞里面具有双螺旋RNA的菌株。该研究成果刊发在《Molecular Cell》杂志上。CRISPR该系统为抗菌株方法助长黎明之前，张锋团队的研究成果管理人员凭借着CRISPR/Cas9该系统为加固免疫反应抵御菌株入侵助长最初借此。然而，入侵有机体的菌株极其多变，即使是在同一种群内，也能大幅专一。因此我们需要更为灵活适度的预防菌株模拟器。为了探究最初抗菌株策略，研究成果管理人员将出乎意料转回了CRISPR Cas13该系统，Cas13蛋白可以天然地类似物细菌里面的菌株RNA。它可以对蛋白质展开演算，从菌株颗粒里面去除特定的核糖核酸序列。尽管CRISPR Cas13该系统仍然不存在一些局限适度，但是该方法在研究中心里面易于操作，并且之前张锋团队的研究成果管理人员在哺乳动物肝细胞里面之前展开了充份的物理证明。研究成果管理人员研发了一种名为CARVER的新型模拟器，它能将Cas13特异适度的菌株RNA混合物与基于Cas13的快速病患读数结合起来，使用特定的高灵敏度蛋白调查报告分子新增（SHERLOCK）模拟器，样品歼灭基于RNA的菌株。创建三合一的该系统研究成果管理人员首先筛选了350多个有机体相关菌株（HAV）测序，以认定Cas13可以有效类似物的菌株RNA序列。他们主要寻觅的是既不易突变，又最意味著在切割成后全面禁止菌株的相片。菌株测序里面潜在的Cas13尽确实位点哈佛Cameron Sabeti研究中心的博士后Myhrvold博士对此：“理论上，你可以演算Cas13来攻击菌株的任何部分。但是种群实际上和种群之间都有不小的多元适度，随着菌株的进化，大部分测序都发生了短时间的变化。如果你不小心，你确实会追求之后不能功效的尽确实。”然后，他们通过计算分析测序数据资料，以确定数百种菌株种群里面的数千个潜在位点，这些位点确实是Cas13的有效特异适度。年里面，研究成果管理人员外观设计了该该系统的Cas13个人兴趣RNA。新演算的Cas13在染病了免疫球蛋白适度脉络膜脑膜炎菌株（LCMV）、亚型流感菌株（IAV）和冻适度口炎菌株（VSV）的有机体肝细胞里面展开了物理验证。将Cas13引入样品后24不间断，研究成果管理人员通过观察到培养物里面菌株RNA的水平减小了40倍。随后，研究成果管理人员检查了Cas1抑制菌株染病适度的能够。研究成果数据资料显示：菌株暴露后八不间断，Cas13将流感菌株的染病力减小了300倍以上。最后，该团队使用SHERLOCK样品技术研发来实时测量Cas13类似物后的菌株RNA水平。该样品该系统发放了有关外科手术功效的快速验证者以及有关特定菌株突变的文档。结语对于菌株染病的外科手术，虽然之前许可了90多种抗菌株制剂，但它们才会外科手术9种疾病。总体而言，只有16种菌株具有FDA许可的制剂。因此，寻觅独创的抗菌株方法显得尤为重要。该研究成果的第一作者 Catherine Freije 对此：“Cas13可以是一种研究成果工具，来探究有机体肝细胞里面菌株生物学的许多方面，它也确实是一种临床工具，用作病患样本，外科手术菌株染病，并衡量外科手术的有效适度——所有这些都能让CARVER在最初或抗适度菌株浮现时短时间适应和应对。”