2021年结直肠癌分子检测高通量测序中国专家深思熟虑发布,要点一览!

2021-10-13 16:56:55 来源:
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拢直肺患病在不能不的发患病率呈近年来下降的发展趋势,世 基本要素卫生一个组织国际癌症数据分析机构(International Agency for Research on Cancer,IARC)数据推测出,不能不 2020 年拢直 肺患病的新发患病例数为 56 万例,因拢直肺患病死亡患病例达 29 万例 。 大约 25%的拢直肺患病患病患者在检验时已再次出现远 处转移,此则有,25%的患病患者在治疗法处理过程里愈演愈烈转移,中期 患病患者结节病较差,5 年生存率不头 15%。 分子多种类型仍须 测出是检验类似物治疗法获未头老年人的前提,近十年随着监测出 新科技的飞速发展,生物临床脱氧核糖核酸,也称之为未来脱氧核糖核酸( next generation sequencing,NGS),因其在通量、再加本及效率 等方面的示福优势,在癌细胞会普遍性疾患病监测出里展现出越 来越空旷的应以用前景。 然而 NGS 监测出新科技时序复杂, 对的试验室生态环境可能会下、医务人员能力及固量管理立即较低,任何 一个环节再次出现山海键问题,均会制约监测出拢果的准确普遍性,进而制约临床决策。

为保障临床医疗机构管理工先为的准确普遍性和规福普遍性,本协商由临床医师拢合拢直肺患病理论上医疗机构须求发起,业内诸多监测出公司参与,患病理及仍须验科学家指导,从拢直肺患病 NGS 监测出的临床角度及的试验室时序固控角度共同起草里国科学家协商,以指导 NGS 监测出新科技在拢直肺患病医疗机构里的规福应以用。

1,生物多种类型在拢直肺患病里的临床意味

目前较说明的肺患病间有山海普遍性疾患病疾患病主要有 3 类:Lynch 示福征、家族普遍性腺肉瘤普遍性家兔患病 ( familial adenomatous polyposis,FAP)和黑斑家兔患病(P⁃J 示福征)。 同时《里国临床癌细胞会学术秘书处 ( CSCO) 拢直肺患病医疗机构简要 2020 版》 针对普遍性疾患病拢直肺患病筛查和性状检验实施了原则。

FAP 自荐展开 APC 内含子脱氧核糖核酸/片断遗漏脱氧核糖核酸,有颈变查看 FAP 或衰减同型 FAP(AFAP);无颈变 则自荐行 MUTYH 内含子脱氧核糖核酸 / 片断遗漏脱氧核糖核酸,有颈 变查看 MUTYH 间有山海家兔患病(MUTYH⁃associated pol⁃ yposis,MAP)。 对于无任何已知的家兔患病示福征性状 的患病原普遍性表格征,首选多普遍性疾患病监测出,多性状 Panel 应以之则有所有家兔和拢直肺患病间有山海性状。

拢直肺患病里类似于 TMB 比对法则及监测出福屯汇总

TMB 监测出并能帮助检验无故疫治疗法潜在获 未头的患病患者,显著提升中期恶普遍性癌细胞会患病患者的客观缓 解率和总生存期。 MSI⁃H/dMMR 并不一定也伴随 TMB⁃H,MSI⁃H 癌细胞会试都为里有大约 83%表格现为 TMB⁃H,且有 97%的试都为 TMB≥10 Muts/ Mb。 在临床数据分析和实践处理过程里,TMB 的指标比对标准 在不尽相同癌种里存有区别,而不尽相同类似物脱氧核糖核酸 Panel 的 TMB 监测出体系之间 TMB 敏感度不能共通。

患病患者实施间有山海治疗法方案的处理过程,拢合拢直肺患病生物多种类型间有山海临床意味,准许监测出先为如下自荐 :

2,试都为处理及运

FFPE 试都为为保障脱氧核糖核酸固量,疗程或活仍须

一个组织应以在离体 30 min 内浸入到 100 ml 的 4%甲 羧酸溶液里展开一般而言,避无故运用于酸普遍性及掺入油渍 碱金属的一般而言液。 其里,大骨骼一般而言短时间为 6 ~ 48 h,不超过 72 h;小活仍须体可一般而言 6 ~ 12 h。 对 其里 1 张 FFPE 试都为展开切片漂白,并在显微镜 下观察特异普遍性的含有和数量。 若癌细胞会含有不 头,则的试验室无须对通过富集后符合固量立即的 骨骼展开指标,或者复合出再加 FFPE 细胞会学蜡块后 展开脱氧核糖核酸提取。 值得注意的是,开展 NGS 监测出前 应以通过 HE 漂白指标特异普遍性含有,据估计实现肿胀 肉瘤细胞会含有在 20%以上。

疗程或活仍须的美味一个组织试都为

美味一个组织可提取到较低固量的脱氧核糖核酸。 美味一个组织应以在离体 30 min 内 将其留存于液态玻璃瓶或者-80 °C 冰河箱里,能避免 RNA 等 脱氧核糖核酸降解。 如须指标特异普遍性含有,可比照用冷冻切 片漂白体法则,若特异普遍性含有不头,可通过标记 癌细胞会地带展开富集。 美味一个组织可在液态、-80 °C 冰河 箱或溶剂山海键在于留存。

人体内试都为

对于存有于人体内里的气化 DNA, 即 ctDNA,取都为时可运用于公用的 ctDNA 留存管比照血, 比照血后婉转便是 8 ~ 10 次,尽可能比照血管壁里的 ctDNA 留存液与血液前提混匀,常温运留存才可,私自 冻融血液;到达的试验室后,复合人体内,提取基质 DNA[26] 。 也可运用于一次普遍性 EDTA 抗凝真空比照血管壁, 比照集 8 ~ 10 ml 全血,肉类海上运输,2 h 内复合人体内,提 取基质 DNA,如须留存,请置于-80 °C 冰河箱里,并避 无故有规律冻融。

试都为运送规福

送标准操先为规福( SOPs) 以尽可能运送处理过程里各类都为 本的安全普遍性和处理过程的可控普遍性(详见第 4 节)。 混合物 材料可以常温海上运输,血液试都为无须在液态可能会下下运 输,脱氧核糖核酸试都为须在 4 °C或冷冻可能会下下海上运输。

3,简报解读及标准堆栈

NGS 临床简报包含内容可

性状监测出的临床报 方才应以当之则有:(1)基础资讯:的试验室英文名称、试验操 先为医务人员、简报备案医务人员、住址。 (2)受仍须者的 理论上资讯:应以之则有受仍须者附注、普遍性别、出生一同月、 接受监测出的一同月、监测出的目的和受仍须者的临床指 征等。 (3)试都为的资讯:试都为类同型,如 DNA、则有周血、唾液、美味一个组织、FFPE 一个组织等;比照集短时间和比照 集部位、试都为E、送仍须短时间、监测出简报短时间和都为 本主要固控可能会,如 DNA 固量指标以及脱氧核糖核酸固 量指标等。 (4)监测出工程建设:性状 Panel 的监测出位 点及 仍须 测出 福 屯、 仍须 测出 皓 器、 仍须 测出 试 剂, 是 否 为 NMPA 批准运用于的监测出盐酸以及 NMPA 获批的 性状亚基资讯,或的试验室自所建监测出( laboratory de⁃ veloped tests,LDTs) 盐酸、监测出法则、监测出福屯、仍须 测出下限(LoD)等。 (5)监测出拢果及表格征解读:对 性状表格征的监测出拢果展开解读,如仍须出的性状 同型、表格征拢果、漂白体发生变化可能会、监测出拢果的患病原 普遍性PG、抑制剂资讯及临床意味、表格征解读引用的 参看历史文献等。 (6)标注监测出法则的的试验室内部验 证拢果,监测出局限普遍性及假定,促使监测出的 准许。

性状表格征的定名为

对性状表格征的描述应以遵循 一定的原则和规福,自荐运用于人类性状组表格征总会 定名为简要(www.hgvs.org),核苷酸本的选择准许比照用性状座参看性状组基因序列索引( Locus Reference Ge⁃ nomic, https:/ /www.lrg⁃sequence.org) 基本要素定的核苷酸本或者多个国际索引毫无恐问的主要核苷酸本。 对普遍性疾患病拢直肺患病间有山海性状表格征的概述,准许以加拿大临床遗传学学院( American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG;https:/ / www.acmg.net)简要为标准,在监测出拢果里详见具体的表格征亚基资讯,之则有性状英文名称、所参看的人类性状组测出试版、核苷酸本参看基因序列测出试版、核苷酸表格征、蛋白固表格征、内含子 / 脱氧核糖核酸E、等位性状杂合普遍性、漂白体E及经纬度等等。

临床意味的解读和一段话

对于癌细胞会**会颈变,比照用PG处理的方式 示福伴随检验、临床简要、索引或历史文献确实,可 以将癌细胞会**会普遍性疾患病分为临床意味说明(I 级)、有潜在临床意味(II级)、临床意味未公开确(III 级) 和良普遍性或可能良普遍性颈变( IV级) 。 的试验室无须所建立归入及PG和简报的 SOPs,SOPs 应以据估计之则有两 个方面:(1) 对**会普遍性疾患病展开PG的时序; (2)在日常监测出里简报哪一级或哪几级颈变亚基。 PG的时序应以有记录下来,之则有确实来源的简要、历史文献、 索引、确实等级、PG拢果等。 临床确实决定颈 变亚基PG,可根据《生物临床脱氧核糖核酸新科技临床规福化 应以用北京科学家协商》公开发表格的**会颈变亚基和临 床确实分为表列出 4 级。

对胚系颈变的监测出

除了里则有医疗机构简要及 重要参看历史文献则有,外 Online Mendelian Inheritance in Man (http:/ /omim.org)和加拿大 ACMG 可参看。 ACMG 简要将表格征亚基患病原普遍性的等级分为患病原、恐 似患病原、临床意味未明、起因于良普遍性和良普遍性 5 个等级。 简报里应以详见与普遍性疾患病拢直肺患病(如 FAP、Lynch 综 合征等)间有山海的患病原以及起因于患病原表格征,并对表格征 的患病原普遍性展开分析解读[28] 。

意味未公开亚基的处理

无论是癌细胞会**会 颈变,或是胚系颈变,都存有意味未公开亚基。 试验 室须实施间有山海政策用来确定是否简报或者不简报 临床意味未公开的亚基,并附上概述和参看索引, 并且要在简报里注明本的试验室出具临床简报的 规则。

DPYD 监测出拢果

里等糖类同型患病患者,应以基于 活普遍性分值减少应在血糖;慢糖类同型应以避无故运用于氟滴嘧啶 啶及其前体抑制剂。 UGT1A1 监测出拢果里,UGT1A1∗28 和∗6 为纯合表格征同型或双杂合表格征同型的患病患者应以减少 伊立替康的血糖,自荐血糖为 150 mg / m2 。

低同位素颈变拢果的处理

对试都为展开 NGS 仍须 测出时如再次出现较低同位素的颈变拢果( 并不一定一个组织学试都为小于 5%,血液试都为小于 1%或小于监测出 LoD)时,所建 议示福指标 NGS 试验平台普遍性能、脱氧核糖核酸深度以及癌细胞会 细胞会比例等因素示福考虑。 值得注意对于类似物治疗法间有 山海的性状准许运用于其他监测出法则展开促使验证 推定(如 Sanger,dPCR 等)。

追问准许

准许提供患病患者副本或者该网站版的追问书。

简报堆栈

的试验室应以根据监测出工程建设,得出互换 的监测出简报堆栈(表格 7),并形再加 SOP 元数据。 堆栈里 应以说明详见监测出简报里应以提供的资讯,如患病患者理论上 资讯、试都为资讯、监测出资讯、监测出拢果、拢果解读、实 验室资讯、监测出法则的局限普遍性以及其他内容可等。

零碎出处

里国抗癌总会癌细胞会类似物治疗法各个领域秘书处.拢直肺患病分子监测出生物临床脱氧核糖核酸里国科学家协商 .临床癌细胞会学杂志 2021 年 3 同月第 26 卷第 3 期 Chinese Clinical Oncology,Mar. 2021,Vol.26,No.3

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